純化水在藥品及醫療器械行業得到了廣泛運用，例如疫苗生產、藥品生產、體外診斷試劑以及各類醫用耗材用水等都有純化水的參與。

為什么純化水會被廣泛用于醫藥行業？我們以藥品為例進行講解，因為普通自來水中有很多雜質是沒辦法和藥品分離開的，所以必須使用純化水，否則藥品就會被污染。

藥品大都是是通過發酵形成的，開始的時候是充滿發酵細菌跟原料的液體。這些液體通過微濾膜進行過濾。除掉發酵的細菌與殘余原料，剩下純凈的、澄清的含藥品物質的溶液。 在這過程中為了盡量保留組成藥品的物質，會多次加水，進行循環過濾。

如果用自來水就會把雜質引入，因為當這些澄清的溶液用超濾或離子交換系統進行有用物質的富集，去水這個過程里自來水中的很多雜質是沒辦法去除的，會和藥品中的有用物質一起富集起來，從而造成藥品污染，所以制藥必須用純化水。

不管是什么藥物在生產過程中都有幾步是液態的，由上可知使用純化水是為了減少藥物的內毒素含量，所以純化水被廣泛用于制藥過程，此外需提醒的是如果是注射針劑類的藥物，那全程使用的則都必須是注射用水。